我國(guó)首臺(tái)全自動(dòng)核酸蛋白共提取平臺(tái)在三亞崖州灣科技城投用
商報(bào)全媒體訊(椰網(wǎng)/海拔新聞?dòng)浾?洪羽宸 通訊員 黃彬彬)近日,記者從三亞崖州灣科技城了解到,我國(guó)首臺(tái)全自動(dòng)核酸蛋白共提取平臺(tái)在三亞崖州灣科技城投用。該平臺(tái)由上海交通大學(xué)海南研究院深部生命國(guó)際研究中心三亞崖州灣研究基地原創(chuàng)實(shí)驗(yàn)技術(shù)、華大集團(tuán)定制開發(fā),樣本處理通量和效率與人工操作相比提升10倍以上,實(shí)驗(yàn)成本指數(shù)級(jí)降低。
該平臺(tái)通過(guò)全自動(dòng)機(jī)械臂整合不同儀器模塊,采用工位流水線設(shè)計(jì)理念,用于各類生物樣本的蛋白、核酸自動(dòng)化高通量共提取,實(shí)現(xiàn)從一份樣本中同時(shí)提取出核酸和蛋白并完成肽段制備,并記錄過(guò)程中產(chǎn)生的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),高效智能地對(duì)接下游的核酸建庫(kù)、測(cè)序、質(zhì)譜檢測(cè)等實(shí)驗(yàn)流程,產(chǎn)生多組學(xué)大數(shù)據(jù)并進(jìn)行宏組學(xué)聯(lián)動(dòng)分析。該平臺(tái)尤其適用于深海微生物樣本等低生物量的珍貴樣本提取,有助于提高實(shí)驗(yàn)效率、縮短數(shù)據(jù)產(chǎn)生周期,便于及時(shí)反饋科研結(jié)果并加快各類生物資源開發(fā)進(jìn)度。
上海交通大學(xué)海南研究院、深部生命國(guó)際研究中心科研人員章陶亮透露,人工手工操作核酸蛋白共提取實(shí)驗(yàn),一份樣本從提取到拿到核酸和蛋白(不包括DNA建庫(kù)和制備肽段)需要一天半的時(shí)間,一次僅能完成8個(gè)深海環(huán)境微生物樣本的提取,而自動(dòng)化核酸蛋白共提取平臺(tái)可同時(shí)進(jìn)行2個(gè)96孔板的交替提取,在相同時(shí)間段內(nèi)一次就能夠完成192個(gè)樣本的提取。
上海交通大學(xué)深部生命國(guó)際研究中心主任、海南研究院肖湘教授表示,深部生命國(guó)際研究中心崖州灣研究基地主要開展深海等極端生境的特種微生物資源化研究,包括極端環(huán)境樣本的采集、特種微生物的富集、分離及特殊功能的解析與資源化應(yīng)用。該基地全力建設(shè)全新一代深海微生物綜合研究平臺(tái),在海南率先實(shí)現(xiàn)深海微生物資源獲取和開發(fā)的數(shù)字化與智能化。其中,全自動(dòng)核酸蛋白共提取平臺(tái)等系列自動(dòng)化科研平臺(tái)的建設(shè),將推動(dòng)深海微生物菌種獲取速度提升10倍、產(chǎn)生數(shù)據(jù)的效率提升百倍,標(biāo)準(zhǔn)化、高效化、智能化的平臺(tái)建設(shè)將有力推動(dòng)海南深海微生物資源產(chǎn)業(yè)化發(fā)展進(jìn)程。
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