西南大學(xué)近日發(fā)布最新研究成果：家蠶基因組生物學(xué)國家重點實驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家代方銀教授團隊完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析（“千蠶基因組”），在全球首次繪就家蠶超級泛基因組圖譜，并率先實現(xiàn)了家蠶這個物種遺傳信息的數(shù)字化——“數(shù)字家蠶”。
家蠶是重要的經(jīng)濟昆蟲和新興模式生物，之前僅有單一參考基因組及部分重測序，不足以支撐基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘，尤其對于分子育種具有顯著局限。而超級泛基因組是一個物種所有基因組信息的總和，對于深化功能基因組研究、種質(zhì)創(chuàng)新等意義重大。
“家蠶超級泛基因組圖譜是涵蓋了蠶的所有遺傳信息的一張圖，通過這張圖我們可以直接對接表型和基因組密碼。”代方銀打比方說，以前鑒定特定性狀的基因或其因果變異猶如“大海撈針”，現(xiàn)在可謂是“甕中捉鱉”，因為超級泛基因組為此提供了“精細網(wǎng)格化”的“坐標”指導(dǎo)，對于行家里手來說像是“查字典”。
據(jù)西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國家重點實驗室教授、博士生導(dǎo)師童曉玲介紹，研究團隊對1078份蠶種質(zhì)資源進行了測序，其中包括47個野桑蠶、205個家蠶地方種、194個實用種和632個突變體，繪制出了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息，是迄今全球動植物領(lǐng)域最大的長讀長泛基因組。同時，團隊還對蠶的各種遺傳變異、群體結(jié)構(gòu)、人工選擇和生態(tài)適應(yīng)性及經(jīng)濟性狀開展了深入的研究，取得了豐碩的創(chuàng)新結(jié)果。
家蠶起源于我國，由中國古野桑蠶馴化而來，具有5000多年的馴養(yǎng)歷史，但其馴化起源地是長期懸而未決的問題，特別是缺乏有力的生物學(xué)證據(jù)。本研究的材料呈現(xiàn)了來自全球各主要養(yǎng)蠶地區(qū)的最豐富的遺傳多樣性，研究發(fā)現(xiàn)黃河中下游地區(qū)的地方種分布在進化樹上家蠶分支的基部，表明家蠶起源于黃河中下游地區(qū)。
